RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 FETUBQ9UGM5 382 aa25■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 HAO1Q9UJM8 370 aa25■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ADORA2AP29274 412 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 EPHX2P34913 555 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 RASSF2P50749 326 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ILDR2Q71H61 639 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 PPTC7Q8NI37 304 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 PLXNB2O15031 1838 aa24.99■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 MICAL2O94851 1124 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ZWINTO95229 277 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 EFHC2Q5JST6 749 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 PHACTR1Q9C0D0 580 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ASB7Q9H672 318 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 CYLDQ9NQC7 956 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 PCNTO95613 3336 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ADCYAP1R1P41586 468 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPN12Q6ZSI9 719 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC35B2Q8TB61 432 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1W2PPM1 405 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 E7ENQ6 273 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 T-ENOLP0DO92 83 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 DYNLT1P63172 113 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 PCGF5Q86SE9 256 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 HPDLQ96IR7 371 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 KATNBL1Q9H079 304 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 SYNCQ9H7C4 482 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 SGK1O00141 431 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 CD48P09326 243 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ATICP31939 592 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 HIF1AQ16665 826 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 VTA1Q9NP79 307 aa24.97■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 M0QYV0 167 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 GPD2P43304 727 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 GPX6P59796 221 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 PLCB3Q01970 1234 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 OTOAQ7RTW8 1153 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM13CQ8NE31 585 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF398Q8TD17 642 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT7P08729 469 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT4P19013 534 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 GNAZP19086 355 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 CALB2P22676 271 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 KDELR1P24390 212 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 PHBP35232 272 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRP7Q8WX94 980 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.96■■□□□ 1.59
AMIGO1-201ENST00000369862 C2CD2LO14523 706 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPAN1O60635 241 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 IFNB1P01574 187 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PAX7P23759 505 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 GABRB2P47870 512 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TAF5Q15542 800 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 TAZQ16635 292 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 FYB2Q5VWT5 728 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTL9Q8TC94 416 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CITO14578 2027 aa24.95■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CST8O60676 142 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 PEX11AO75192 247 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP3A5P20815 502 aa24.94■■□□□ 1.58
AMIGO1-201ENST00000369862 HADHQ16836 314 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms