RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 BCAT1P54687 386 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 MBTPS1Q14703 1052 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ACAP1Q15027 740 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ODF2Q5BJF6 829 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 NOMO2Q5JPE7 1267 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4A22Q5TCH4 519 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC38Q5VT99 294 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM110Q86TL2 294 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ABI1Q8IZP0 508 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 THEM5Q8N1Q8 247 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35F5Q8WV83 523 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 RUBCNQ92622 972 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ALG3Q92685 438 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 HSFY1Q96LI6 401 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 MCEEQ96PE7 176 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CPXM1Q96SM3 734 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CYLDQ9NQC7 956 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM49BQ9NUQ9 324 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 LRFN2Q9ULH4 789 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGGTB-201ENST00000319942 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC14CA4D256 554 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC151A5D8V7 595 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINT1O43278 529 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 PSTPIP1O43586 416 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC3O43617 180 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF8O76064 485 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf54Q08AI8 447 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 BST2Q10589 180 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf53Q5VUE5 145 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6B2Q6IFH4 312 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR93Q6P2C0 686 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 MAATS1Q7Z4T9 603 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 XYLT1Q86Y38 959 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC116Q8IYX3 515 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 RCOR2Q8IZ40 523 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 RSPH1Q8WYR4 309 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 NCAPGQ9BPX3 1015 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM7Q9C029 511 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 HIPK3Q9H422 1215 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ASNSD1Q9NWL6 643 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 CYTH4Q9UIA0 394 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM59LQ9UK28 342 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB21Q9UL25 225 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH9Q9ULB4 789 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 USTQ9Y2C2 406 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 NBNO60934 754 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ERBB2P04626 1255 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 PYGMP11217 842 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMA2P25787 234 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ADORA2BP29275 332 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.715e-8■■□□□ 13.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 TLE2Q04725 743 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE4CQ08493 712 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP9Q49MG5 647 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf74Q6P047 294 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 PMF1Q6P1K2 205 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT35Q92764 455 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT12Q99456 494 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ACBD6Q9BR61 282 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 MED10Q9BTT4 135 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC1Q9BTT6 524 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP16Q9BY84 665 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 EPC1Q9H2F5 836 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 DPEP3Q9H4B8 488 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGGTB-201ENST00000319942 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms