RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 TMC6Q7Z403 805 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 STKLD1Q8NE28 680 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 STK32AQ8WU08 396 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD13Q8WZ19 329 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CORO1BQ9BR76 489 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SYT11Q9BT88 431 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 IL21Q9HBE4 155 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CLUHO75153 1309 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MFAP3LO75121 409 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ADCY5O95622 1261 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 FGF19O95750 216 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 MMEP08473 750 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TPM1P09493 284 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CHRNB2P17787 502 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 KIF11P52732 1056 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NTHL1P78549 312 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 FMO1Q01740 532 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 TFF2Q03403 129 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ARID5AQ03989 594 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 AAK1Q2M2I8 961 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CYP4A22Q5TCH4 519 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PMF1Q6P1K2 205 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 HSFY1Q96LI6 401 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC7Q99615 494 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 POMKQ9H5K3 350 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CYLDQ9NQC7 956 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 FAM50BQ9Y247 325 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 CEP83Q9Y592 693 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 USP3Q9Y6I4 520 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 NCANO14594 1321 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 XIRP2A4UGR9 3374 aa13.96□□□□□ -0.17
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF197O14709 1029 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 MOSPD3O75425 235 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TADA3O75528 432 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 LSM8O95777 96 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 F11P03951 625 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 YWHAQP27348 245 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CDC25CP30307 473 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CCR2P41597 374 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SLC5A9Q2M3M2 681 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TAF3Q5VWG9 929 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 HGSNATQ68CP4 663 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM72Q6ZMU5 477 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 GAREM2Q75VX8 874 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM150AQ86TG1 271 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 GPIHBP1Q8IV16 184 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CNGA4Q8IV77 575 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SCML4Q8N228 414 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 OLIG1Q8TAK6 271 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 OVCA2Q8WZ82 227 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 HELZP42694 1942 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 MYL4P12829 197 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 FSHRP23945 695 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 GABRR2P28476 465 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PPP3CCP48454 512 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 NOMO3P69849 1222 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TAF10Q12962 218 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PDCLQ13371 301 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM110Q86TL2 294 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PASD1Q8IV76 773 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 DRC7Q8IY82 874 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM35BQ8NCS4 154 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PDZD8Q8NEN9 1154 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 OR8K1Q8NGG5 319 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SHKBP1Q8TBC3 707 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SLITRK1Q96PX8 696 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 AGPAT1Q99943 283 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 PDCL3Q9H2J4 239 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 HAUS4Q9H6D7 363 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 CNGB3Q9NQW8 809 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 ABHD10Q9NUJ1 306 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SCML2Q9UQR0 700 aa13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
CCDC42-201ENST00000293845 SOBPA7XYQ1 873 aa13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms