RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 RIN3Q8TB24 985 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF560Q96MR9 790 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ITGB3P05106 788 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 MAP3K7CLP57077 242 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DMPKQ09013 629 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CCNG2Q16589 344 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KRT35Q92764 455 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC126Q96EE4 140 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 EVPLLA8MZ36 301 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CES2O00748 559 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF197O14709 1029 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PSMD3O43242 534 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ATP4AP20648 1035 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NNMTP40261 264 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CYTH3O43739 400 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 MYL3P08590 195 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 HIST1H2ADP20671 130 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SLC1A6P48664 564 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PDIA6Q15084 440 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 STILQ15468 1287 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 GALNTL6Q49A17 601 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ACAD9Q9H845 621 aa6.56□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PDK1Q15118 436 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 HES6Q96HZ4 224 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ABHD8Q96I13 439 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KRT87PA6NCN2 255 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 GSNP06396 782 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ATP6V1B2P21281 511 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ARL10Q8N8L6 244 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.55□□□□□ -1.36
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SBNO1-201ENST00000267176 PRKCEQ02156 737 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ST3GAL1Q11201 340 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ORC1Q13415 861 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CEP78Q5JTW2 689 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 FAM136AQ96C01 138 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 LAMA4Q16363 1823 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 UNC5CO95185 931 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 IMPDH2P12268 514 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CHRM3P20309 590 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 PPP3CCP48454 512 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NME5P56597 212 aa6.55□□□□□ -1.36
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SBNO1-201ENST00000267176 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 CPB1P15086 417 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 POU4F1Q01851 419 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 KYAT1Q16773 422 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF333Q96JL9 665 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 C2CD2Q9Y426 696 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 TIMM44O43615 452 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-201ENST00000267176 EFCAB14O75071 495 aa6.55□□□□□ -1.36
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