RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TET3O43151 1660 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 WDR19Q8NEZ3 1342 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 HBP1O60381 514 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF682O95780 498 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 GLRA4Q5JXX5 417 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CASP10Q92851 521 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 VPS33BQ9H267 617 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 C10orf88Q9H8K7 445 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 POLR1DQ9Y2S0 133 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TPST1O60507 370 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 AP1G2O75843 785 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 RFC5P40937 340 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 FAM45BPQ6NSW5 357 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CST8O60676 142 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SPAG6O75602 509 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 MAGEA4P43358 317 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SEMA3FQ13275 785 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 FEZF2Q8TBJ5 459 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SPON1Q9HCB6 807 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 FBXO10Q9UK96 956 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 BTN2A1Q7KYR7 527 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TRPC4APQ8TEL6 797 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 B2RBV5 119 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 C4orf22Q6V702 233 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 HERC6Q8IVU3 1022 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SH3GL1Q99961 368 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SNX12Q9UMY4 172 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TERF2Q15554 542 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 MTSS1LQ765P7 747 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 KIFC1Q9BW19 673 aa17■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 GPR182O15218 404 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PLA2G6O60733 806 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 HLA-DRAP01903 254 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 FGFR2P21802 821 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.99■□□□□ 0.313e-6■■□□□ 11.9
LAMC1-201ENST00000258341 OLFM1Q99784 485 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PPP2R1BP30154 601 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CARD9Q9H257 536 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 KLHL31Q9H511 634 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1W2PQC6 194 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CETPP11597 493 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF23P17027 643 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PNPLA4P41247 253 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CDK20Q8IZL9 346 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC126Q96EE4 140 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM22K7EJ46 135 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 FNTAP49354 379 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 NACC2Q96BF6 587 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 KRT34O76011 436 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CLTBP09497 229 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PSMC3P17980 439 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 ERP27Q96DN0 273 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 RNFT2Q96EX2 444 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 EPC1Q9H2F5 836 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 VTA1Q9NP79 307 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 EPHB3P54753 998 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 PARNO95453 639 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 DNAJB2P25686 324 aa16.98■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 COPAP53621 1224 aa16.98■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.98■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
LAMC1-201ENST00000258341 TPD52L3Q96J77 140 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms