RNA–Protein interactions for RNA: YOR073W

SGO1, Transcript of Component of the spindle checkpoint, yeast

Gene SGO1, Length 1,773 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGO1	YOR073W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	SNF2	P22082	1703 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	CAT8	P39113	1433 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	FYV7	Q12247	151 aa		0.39	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YLR255C	O13574	117 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	UBC5	P15732	148 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	PAU16	P35994	123 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	PAU15	P40585	124 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	HUR1	P45820	110 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	COX19	Q3E731	98 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YOS1	Q3E834	85 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YBR090C	P38253	122 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YBR292C	P38357	123 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YHL005C	P38752	130 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	LYS2	P07702	1392 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	KRE5	P22023	1365 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	TSC11	P40061	1430 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	AIM19	P40502	157 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	MIX14	Q04341	121 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	SCP1	Q08873	200 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	COA2	Q3E823	68 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.37	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	REV3	P14284	1504 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	SNA2	P56508	79 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.36	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YCR101C	P25607	182 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	IMP2	P46972	177 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YIL086C	P40503	102 aa		0.34	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	BNI1	P41832	1953 aa		0.34	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	SRB8	P25648	1427 aa		0.34	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	PDR11	P40550	1411 aa		0.34	□□□□□ -2.35
SGO1	YOR073W	CCW14	O13547	238 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	UBC4	P15731	148 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	MPC2	P38857	129 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	YHR173C	P38864	112 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU20	Q08322	120 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	RSF2	P46974	1380 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	ECM12	O13529	151 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	COX7	P10174	60 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	TOM6	P33448	61 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	YBR032W	P38223	100 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU13	P38725	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	SHU1	P38751	150 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	RSM18	P40033	138 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	YGR025W	P53216	100 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU4	P53427	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	MRX7	P53869	86 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU10	Q03050	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	BPT1	P14772	1559 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	PAU5	P43575	122 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	BLM10	P43583	2143 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	BSC4	P53841	131 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	ICY1	Q04329	127 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	HUB1	Q6Q546	73 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	LTE1	P07866	1435 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	YSP2	Q06681	1438 aa		0.32	□□□□□ -2.36
SGO1	YOR073W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.32	□□□□□ -2.36

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