RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 FETUBQ9UGM5 382 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 HAO1Q9UJM8 370 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 USH1CQ9Y6N9 552 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 C1QAP02745 245 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PGK2P07205 417 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 GM2AP17900 193 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 BANPQ8N9N5 519 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ATP11CQ8NB49 1132 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PYROXD1Q8WU10 500 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 HSPH1Q92598 858 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 COPS5Q92905 334 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 MCRS1Q96EZ8 462 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 C15orf41Q9Y2V0 281 aa13.99□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KRT7P08729 469 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CLCN3P51790 818 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ARL4CP56559 192 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CTC1Q2NKJ3 1217 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 POTEAQ6S8J7 498 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 SH2D5Q6ZV89 423 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF570Q96NI8 536 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PLAC1Q9HBJ0 212 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ACKR2O00590 384 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CILPO75339 1184 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CBX6O95503 412 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 APOC2P02655 101 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KRT19P08727 400 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 RPSAP08865 295 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 GABRB2P47870 512 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 NCAPG2Q86XI2 1143 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 RFWD2Q8NHY2 731 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CHMP2BQ9UQN3 213 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CEP83Q9Y592 693 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PIK3R2O00459 728 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ENDOD1O94919 500 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 GPD2P43304 727 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 JADE1Q6IE81 842 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PCGF5Q86SE9 256 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 RFX6Q8HWS3 928 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 SERAC1Q96JX3 654 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 USP18Q9UMW8 372 aa13.98□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 LACTBL1A8MY62 500 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TNNC2P02585 160 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ITGB3P05106 788 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 DPYSL3Q14195 570 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KCNJ11Q14654 390 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 BBS9Q3SYG4 887 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 FAM167AQ96KS9 214 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PPCSQ9HAB8 311 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 NPHS2Q9NP85 383 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 WDR91A4D1P6 747 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 AVILO75366 819 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 OVGP1Q12889 678 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 SURF1Q15526 300 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 AMHR2Q16671 573 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KIRREL3Q8IZU9 778 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 KCTD6Q8NC69 237 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 RSAD2Q8WXG1 361 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC37BQ96QE4 947 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TXLNGQ9NUQ3 528 aa13.97□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ZWINTO95229 277 aa13.96□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PFKMP08237 780 aa13.96□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 TGFB3P10600 412 aa13.96□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 ELK3P41970 407 aa13.96□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 HHATQ5VTY9 493 aa13.96□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 RPAINQ86UA6 219 aa13.96□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.96□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms