RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 PRAMEF12O95522 483 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CD58P19256 250 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 AOC1P19801 751 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 NUBP1P53384 320 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 USP46P62068 366 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 PRKCQQ04759 706 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 SLC44A4Q53GD3 710 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TXNDC8Q6A555 127 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TATDN2Q93075 761 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 DNAI2Q9GZS0 605 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TBC1D17Q9HA65 648 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 DPYSL4O14531 572 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 P4HA2O15460 535 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CCDC130P13994 396 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 GDI1P31150 447 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 AVPR1AP37288 418 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 IER5LQ5T953 404 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TMEM105Q8N8V8 129 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 C12orf29Q8N999 325 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 SLC2A14Q8TDB8 520 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 MED15Q96RN5 788 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 KRT82Q9NSB4 513 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CISHQ9NSE2 258 aa26.42■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CCDC192P0DO97 292 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 PPP3CCP48454 512 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 NUP93Q8N1F7 819 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 LRRC3BQ96PB8 259 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 KCNK16Q96T55 309 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 PRRX2Q99811 253 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 ARID3AQ99856 593 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 FAM49BQ9NUQ9 324 aa26.41■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 ARNTLO00327 626 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 ZNF263O14978 683 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CHADO15335 359 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 AP1G2O75843 785 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 GPIHBP1Q8IV16 184 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 YAF2Q8IY57 180 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 GPT2Q8TD30 523 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 KIF9Q9HAQ2 790 aa26.4■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 MYO16Q9Y6X6 1858 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TNFRSF10BO14763 440 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 PFKLP17858 780 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CETN1Q12798 172 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CUL2Q13617 745 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 ZMIZ2Q8NF64 920 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 BPIFB1Q8TDL5 484 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 CYFIP2Q96F07 1278 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 SMOQ99835 787 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TDP1Q9NUW8 608 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 IL37Q9NZH6 218 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa26.39■■□□□ 1.82
PMS1-220ENST00000618056 COL4A3Q01955 1670 aa26.39■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 RFX1P22670 979 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 KCNH2Q12809 1159 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 SLITRK1Q96PX8 696 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 COMMD8Q9NX08 183 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 GCNT4Q9P109 453 aa26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 STK25O00506 426 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 PI15O43692 258 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 FAM200BP0CF97 657 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 SLC4A11Q8NBS3 891 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 LMO3Q8TAP4 145 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 OVCA2Q8WZ82 227 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 TRPC7Q9HCX4 862 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 HEBP1Q9NRV9 189 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 CCL26Q9Y258 94 aa26.37■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 KANSL1LA0AUZ9 987 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 FAM92AA1XBS5 289 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 ZNF840PA6NDX5 716 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 BEST1O76090 585 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 USP17L7P0C7H9 530 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 YWHAQP27348 245 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 PDE6CP51160 858 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 SLC5A3P53794 718 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 RAD23BP54727 409 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 PLCB2Q00722 1185 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 TAF10Q12962 218 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 ZNF394Q53GI3 561 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 CLEC20AQ6ZU45 233 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 TMEM176AQ96HP8 235 aa26.36■■□□□ 1.81
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A12Q96S37 553 aa26.36■■□□□ 1.81
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