RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	CISH	Q9NSE2	258 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		18.71	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	18.71	■□□□□ 0.59
ATG13-223	ENST00000577256	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF263	O14978	683 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	PRAMEF12	O95522	483 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	NPR3	P17342	541 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	PPP3CC	P48454	512 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	USP46	P62068	366 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CUL2	Q13617	745 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	NUP93	Q8N1F7	819 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	GPT2	Q8TD30	523 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	PRRX2	Q99811	253 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	NCAN	O14594	1321 aa		18.7	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	STK25	O00506	426 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CHAD	O15335	359 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	FAM200B	P0CF97	657 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	PFKL	P17858	780 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	AOC1	P19801	751 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	PDE6C	P51160	858 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	NUBP1	P53384	320 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	STARD6	P59095	220 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	KCNH2	Q12809	1159 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	NT5C1B	Q96P26	610 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	KCNK16	Q96T55	309 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ARID3A	Q99856	593 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	COMMD8	Q9NX08	183 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		18.69	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	MBD3	O95983	291 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	YWHAQ	P27348	245 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ADORA2B	P29275	332 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF394	Q53GI3	561 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	MED15	Q96RN5	788 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	SMO	Q99835	787 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TDP1	Q9NUW8	608 aa		18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TNFRSF10B	O14763	440 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	CKM	P06732	381 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	USP17L7	P0C7H9	530 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	SLC5A3	P53794	718 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	RAD23B	P54727	409 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	MAP3K7CL	P57077	242 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	PLCB2	Q00722	1185 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	LRMP	Q12912	555 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TAF10	Q12962	218 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	IER5L	Q5T953	404 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	FBXO32	Q969P5	355 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	IL37	Q9NZH6	218 aa		18.67	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	PATJ	Q8NI35	1801 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	C2orf78	A6NCI8	922 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	ARNTL	O00327	626 aa		18.66	■□□□□ 0.58
ATG13-223	ENST00000577256	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58

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