RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577001.1

PRPF8-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, human

TSL 5

Gene PRPF8, Length 3,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF8-216	ENST00000577001	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	UNC5C	O95185	931 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KRT81	Q14533	505 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MPP5	Q8N3R9	675 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	AKT3	Q9Y243	479 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MAPK13	O15264	365 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PDGFRA	P16234	1089 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RBL1	P28749	1068 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RPAIN	Q86UA6	219 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MORC4	Q8TE76	937 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	LPAR1	Q92633	364 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TTC1	Q99614	292 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PPEF2	O14830	753 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	USP12	O75317	370 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	USP1	O94782	785 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	HMGCR	P04035	888 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	INHBA	P08476	426 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MYL2	P10916	166 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ACOT1	Q86TX2	421 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	AGAP3	Q96P47	875 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ELP3	Q9H9T3	547 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PSTPIP1	O43586	416 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TOM1L1	O75674	476 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GBP1	P32455	592 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	UCMA	Q8WVF2	138 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KLK14	Q9P0G3	267 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GGA2	Q9UJY4	613 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KRT34	O76011	436 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	LYPLA2	O95372	231 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF286B	P0CG31	522 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ADORA2B	P29275	332 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GALNTL6	Q49A17	601 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	WLS	Q5T9L3	541 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PDIK1L	Q8N165	341 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MIPEP	Q99797	713 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001		A0A087WZ62	844 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001		H3BRJ5	948 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GPR25	O00155	361 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	KDELR1	P24390	212 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ALDH3A1	P30838	453 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ABL2	P42684	1182 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ARL4C	P56559	192 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	JADE1	Q6IE81	842 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	CIT	O14578	2027 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	LACTBL1	A8MY62	500 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PRPF8-216	ENST00000577001	RNF8	O76064	485 aa		15.47	■□□□□ 0.07

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