RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	INSR	P06213	1382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FLT4	P35916	1363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LRP5	O75197	1615 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RECQL4	O94761	1208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LDHC	P07864	332 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RARB	P10826	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	HDC	P19113	662 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	NHLH2	Q02577	135 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431		Q8TCH9	128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TBCB	Q99426	244 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MNT	Q99583	582 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	NSD2	O96028	1365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TBX3	O15119	743 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ANXA1	P04083	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MYF5	P13349	255 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	AK2	P54819	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ICAM4	Q14773	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CNGA2	Q16280	664 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	APIP	Q96GX9	242 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MYD88	Q99836	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PANK3	Q9H999	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	BTAF1	O14981	1849 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431		M0QYG6	137 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	VPS4B	O75351	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MATN4	O95460	622 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CKB	P12277	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	NPR1	P16066	1061 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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