RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 GABRB2P47870 512 aa25.18■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CREMQ03060 361 aa25.18■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 GPR17Q13304 367 aa25.18■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ALS2CR12Q96Q35 445 aa25.18■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 NUP85Q9BW27 656 aa25.18■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 SALL4Q9UJQ4 1053 aa25.18■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 MOCS3O95396 460 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TUBB4AP04350 444 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ERBB2P04626 1255 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 GNG11P61952 73 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TCEAL1Q15170 157 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 SLC8B1Q6J4K2 584 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 DNAJC24Q6P3W2 148 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 PIGZQ86VD9 579 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 DEFB123Q8N688 67 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 SAMD11Q96NU1 681 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 SMOQ99835 787 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 LZTS1Q9Y250 596 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 E5RJQ4 531 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CA3P07451 260 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM110Q86TL2 294 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ABCB6Q9NP58 842 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 EYSQ5T1H1 3165 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 BEST1O76090 585 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 RB1P06400 928 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 DNAJB2P25686 324 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 OR1D2P34982 312 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 XYLT1Q86Y38 959 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 C3orf20Q8ND61 904 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM58Q8NG06 486 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 FAM161BQ96MY7 647 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ZBP1Q9H171 429 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC4Q9HBW1 653 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TJP2Q9UDY2 1190 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CTSAP10619 480 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CYP2F1P24903 491 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CA8P35219 290 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 GRIK1P39086 918 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 MAGEA11P43364 429 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ETF1P62495 437 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 OR6B2Q6IFH4 312 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 GPR153Q6NV75 609 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 VSTM1Q6UX27 236 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 SELENOOQ9BVL4 669 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 MSRAQ9UJ68 235 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA8SH3BPF8 625 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 PIK3R2O00459 728 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 MTA2O94776 668 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 LCP1P13796 627 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TNNT1P13805 278 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 RPL34P49207 117 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 HADHBP55084 474 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ROR1Q01973 937 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TAP1Q03518 808 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 MAMLD1Q13495 774 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 TMC7Q7Z402 723 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 KCNK16Q96T55 309 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 CLSTN3Q9BQT9 956 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.15■■□□□ 1.62
MEIS3-204ENST00000558555 MTMR11A4FU01 709 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 CACNA2D1P54289 1103 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 UBE3AQ05086 875 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 RAB30Q15771 203 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 SCN4BQ8IWT1 228 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 ZMIZ2Q8NF64 920 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.14■■□□□ 1.61
MEIS3-204ENST00000558555 MCRS1Q96EZ8 462 aa25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms