RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 SPATA33Q96N06 139 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 CATSPER2Q96P56 530 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SIK2Q9H0K1 926 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGEF9O43307 516 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KCNA2P16389 499 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 STILQ15468 1287 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 DUPD1Q68J44 220 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KAT2BQ92831 832 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ULK4Q96C45 1275 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KIF12Q96FN5 646 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 NR3C2P08235 984 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 BOLA3Q53S33 107 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 IFT43Q96FT9 208 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 AP3B1O00203 1094 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 MYL3P08590 195 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SREBF1P36956 1147 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 MYBPC2Q14324 1141 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ACCSLQ4AC99 568 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 APPL1Q9UKG1 709 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ATP8B3O60423 1300 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 NCALDP61601 193 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 BMPR2Q13873 1038 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 MAP3K6O95382 1288 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 TPI1P60174 286 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 CDK16Q00536 496 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 CXCL9Q07325 125 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa20.09■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 MMP13P45452 471 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PTK6Q13882 451 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 E9PBE3 544 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KLHL41O60662 606 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 STAT5BP51692 787 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 EMC2Q15006 297 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 IL17AQ16552 155 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.08■□□□□ 0.81
SUDS3-204ENST00000543473 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 RALBP11234 206 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 GRK2P25098 689 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 GSTT1P30711 240 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 HADHAP40939 763 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 PLD3Q8IV08 490 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 ATG4CQ96DT6 458 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 ATP6V1C1P21283 382 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.08■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 TBC1D4O60343 1298 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 CAP2P40123 477 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 SERPINB8P50452 374 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 SV2AQ7L0J3 742 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 PLSCR1O15162 318 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 PRELID2Q8N945 189 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 PRKCEQ02156 737 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 ALBP02768 609 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 MUTP22033 750 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 SERPINB1P30740 379 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 NUP107P57740 925 aa20.07■□□□□ 0.8
SUDS3-204ENST00000543473 TGFB2P61812 414 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms