RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTPRK-222ENST00000532751 KCNK16Q96T55 309 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRK-222ENST00000532751 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRK-222ENST00000532751 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTPRK-222ENST00000532751 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.26■■□□□ 1.31
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PTPRK-222ENST00000532751 SMOQ99835 787 aa23.26■■□□□ 1.31
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PTPRK-222ENST00000532751 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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PTPRK-222ENST00000532751 NDST4Q9H3R1 872 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRK-222ENST00000532751 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.24■■□□□ 1.31
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PTPRK-222ENST00000532751 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRK-222ENST00000532751 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRK-222ENST00000532751 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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PTPRK-222ENST00000532751 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRK-222ENST00000532751 TNFRSF10BO14763 440 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRK-222ENST00000532751 PAEPP09466 180 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRK-222ENST00000532751 PFKLP17858 780 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRK-222ENST00000532751 MYL5Q02045 173 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRK-222ENST00000532751 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.22■■□□□ 1.31
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