RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 CCL16O15467 120 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 PTPN2P17706 415 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 CDC25BP30305 580 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 KRT9P35527 623 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 AAK1Q2M2I8 961 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 TMC5Q6UXY8 1006 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 S1PR5Q9H228 398 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 REV3LO60673 3130 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 PLA2G4AP47712 749 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 MAP3K7CLP57077 242 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 DDR2Q16832 855 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 LEXMQ3ZCV2 418 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 PKDCCQ504Y2 493 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 ATAT1Q5SQI0 421 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 TTC30AQ86WT1 665 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 CNGA4Q8IV77 575 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 SMOQ99835 787 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 ASAH2Q9NR71 780 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 THEGQ9P2T0 379 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 NOTCH4Q99466 2003 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 DOCK6Q96HP0 2047 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 SOAT2O75908 522 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 MICAL2O94851 1124 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 CASP14P31944 242 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 ASIC2Q16515 512 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 TMC6Q7Z403 805 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 NUP93Q8N1F7 819 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 MYRFLQ96LU7 910 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 NOX5Q96PH1 765 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 ZSWIM1Q9BR11 485 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 LHX5Q9H2C1 402 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 PDCL3Q9H2J4 239 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 FBXO44Q9H4M3 255 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 GRPEL1Q9HAV7 217 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRK-218ENST00000525459 LSM8O95777 96 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 PRKCIP41743 596 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 CACNA2D1P54289 1103 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 EPHA5P54756 1037 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 CDR2Q01850 454 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM72Q6ZMU5 477 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 ZMIZ2Q8NF64 920 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 STK32AQ8WU08 396 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 KCNK16Q96T55 309 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 TTLL2Q9BWV7 592 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 CYLDQ9NQC7 956 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM30AQ9NV96 361 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 SLC38A8A6NNN8 435 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 CDR1P51861 262 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 SLC5A3P53794 718 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 SNX16P57768 344 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 PDE4CQ08493 712 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 ARID5BQ14865 1188 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 CYP4A22Q5TCH4 519 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 KCTD13Q8WZ19 329 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 HSFY1Q96LI6 401 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 GCNAQ96QF7 691 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 ACP6Q9NPH0 428 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 ZMYM5Q9UJ78 669 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 CLUHO75153 1309 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 H3BQ06 376 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF197O14709 1029 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 MFAP3LO75121 409 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 BEST1O76090 585 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 ADCY5O95622 1261 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 CDC25CP30307 473 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 PPP3CCP48454 512 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 GPR15P49685 360 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 ARID5AQ03989 594 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 PIGZQ86VD9 579 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 PDZD8Q8NEN9 1154 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 GIPC2Q8TF65 315 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 SLC35F5Q8WV83 523 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 CPLX3Q8WVH0 158 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 OVCA2Q8WZ82 227 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 SUSD6Q92537 303 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 SLITRK1Q96PX8 696 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 NCANO14594 1321 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 TNFRSF10BO14763 440 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 RHOP08100 348 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRK-218ENST00000525459 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms