RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 TEX13BQ9BXU2 312 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 NYAP2Q9P242 653 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SCOCQ9UIL1 159 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.9□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 SIPA1L1O43166 1804 aa4.89□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SEPT4O43236 478 aa4.89□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 AKR1A1P14550 325 aa4.89□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 C12orf60Q5U649 245 aa4.89□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 FERMT2Q96AC1 680 aa4.89□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 DEFB118Q96PH6 123 aa4.89□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa4.89□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.89□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 GJD2Q9UKL4 321 aa4.89□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF532Q9HCE3 1301 aa4.89□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 FLOT1O75955 427 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TTLL1O95922 423 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CFBP00751 764 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RARBP10826 455 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 STAT2P52630 851 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RAC3P60763 192 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CD69Q07108 199 aa4.88□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 ACAP1Q15027 740 aa4.88□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 TBR1Q16650 682 aa4.88□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 AGBL4Q5VU57 503 aa4.88□□□□□ -1.63
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HDAC2-216ENST00000523628 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DNAI1Q9UI46 699 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 Q9Y3F1 56 aa4.88□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CENPFP49454 3210 aa4.88□□□□□ -1.63
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