RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 EID1Q9Y6B2 187 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 ISM1B1AKI9 464 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 TBX3O15119 743 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 FRS3O43559 492 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 SCGB1D2O95969 90 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 CERS1P27544 350 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 ADORA2AP29274 412 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 PRKAG1P54619 331 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 TPTEP56180 551 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 CYP4F2P78329 520 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC41Q15345 812 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-221ENST00000514231 USP19O94966 1318 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CFAP69A5D8W1 941 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TISP43B9A030 160 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PRRT4C9JH25 899 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 LY6KQ17RY6 165 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MAML1Q92585 1016 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM233B4DJY2 109 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CTGFP29279 349 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CCNIQ14094 377 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 APOA5Q6Q788 366 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MICU3Q86XE3 530 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SPSB4Q96A44 273 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM5Q9C035 493 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 H7C1Q1 480 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SMIM22K7EJ46 135 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CACNB3P54284 484 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MLC1Q15049 377 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 INSCQ1MX18 579 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SPARTQ8N0X7 666 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 JDP2Q8WYK2 163 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 STK32BQ9NY57 414 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 WDR91A4D1P6 747 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 HRGP04196 525 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TUBB4AP04350 444 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PRR35P0CG20 571 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 KELP23276 732 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PRKAR1BP31321 381 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF81P51508 661 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 BCAT1P54687 386 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CNGA2Q16280 664 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CYP1B1Q16678 543 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MTX3Q5HYI7 312 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 RNF220Q5VTB9 566 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CHSY1Q86X52 802 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TERB1Q8NA31 727 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 OR56A3Q8NH54 315 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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