RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 CCDC192P0DO97 292 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 EPHA5P54756 1037 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 GRIN1Q05586 938 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 FAPQ12884 760 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 LONRF3Q496Y0 759 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 ARMCX2Q7L311 632 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 EFHBQ8N7U6 833 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 CHTF18Q8WVB6 975 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 SMARCE1Q969G3 411 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 PEX11GQ96HA9 241 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 MAML3Q96JK9 1138 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.03□□□□□ -1.12
HERC3-210ENST00000512194 PP2D1A8MPX8 630 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ULK1O75385 1050 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 KCNA2P16389 499 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 CAPN2P17655 700 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 CYP2B6P20813 491 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 CDC25AP30304 524 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 PSMC5P62195 406 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 IRF9Q00978 393 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 NR1I3Q14994 352 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 POSTNQ15063 836 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 HYIQ5T013 277 aa8.02□□□□□ -1.13
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HERC3-210ENST00000512194 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 METTL7BQ6UX53 244 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 USP49Q70CQ1 688 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 PASD1Q8IV76 773 aa8.02□□□□□ -1.13
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HERC3-210ENST00000512194 AZI2Q9H6S1 392 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 EMC7Q9NPA0 242 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ANO10Q9NW15 660 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 OXSMQ9NWU1 459 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.02□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.02□□□□□ -1.13
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HERC3-210ENST00000512194 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.01□□□□□ -1.13
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HERC3-210ENST00000512194 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 PARP14Q460N5 1801 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 SYCE3A1L190 88 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 HIP1RO75146 1068 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 GGPS1O95749 300 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 GH1P01241 217 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 MPOP05164 745 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 PLA2G4BP0C869 781 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 GJA4P35212 333 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ID4P47928 161 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 TMPRSS15P98073 1019 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ACVR2BQ13705 512 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 SLC9A5Q14940 896 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 RAD54LQ92698 747 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 DYDC2Q96IM9 177 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 GSDMAQ96QA5 445 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 PLIN2Q99541 437 aa8.01□□□□□ -1.13
HERC3-210ENST00000512194 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.01□□□□□ -1.13
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