RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 EXD1Q8NHP7 514 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 HASPINQ8TF76 798 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SYT15Q9BQS2 421 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 AMACRQ9UHK6 382 aa22.05■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 BEST1O76090 585 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 FLT3P36888 993 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SLC6A3Q01959 620 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 LLGL1Q15334 1064 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CYP1B1Q16678 543 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 DUSP16Q9BY84 665 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ODC1P11926 461 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PAX3P23760 479 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 IL1R2P27930 398 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 TNFRSF8P28908 595 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PLCB3Q01970 1234 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CASP8Q14790 479 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SPATA18Q8TC71 538 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SCLYQ96I15 445 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 HSFY1Q96LI6 401 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PLVAPQ9BX97 442 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CYLDQ9NQC7 956 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CDH9Q9ULB4 789 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 TET1Q8NFU7 2136 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CXCL10P02778 98 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CAPN2P17655 700 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 TRADDQ15628 312 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 TTC27Q6P3X3 843 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SEPT8Q92599 483 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SUSD3Q96L08 255 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PHF2O75151 1096 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 GRAP2O75791 330 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CAPN15O75808 1086 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 NPR3P17342 541 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 GJC1P36383 396 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CDR1P51861 262 aa22.02■■□□□ 1.12
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GPC1-202ENST00000420138 GPS2Q13227 327 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ACAP1Q15027 740 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PIGZQ86VD9 579 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 PCED1BQ96HM7 432 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.02■■□□□ 1.12
GPC1-202ENST00000420138 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 ESYT3A0FGR9 886 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 TTI1O43156 1089 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 RALAP11233 206 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 GPD1P21695 349 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 CCL23P55773 120 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 PPP2R5EQ16537 467 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 RAB6CQ53S08 254 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 RAPGEF5Q92565 580 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 APBB2Q92870 758 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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GPC1-202ENST00000420138 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 DPYSL4O14531 572 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 PDGFRAP16234 1089 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 CYP2C18P33260 490 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 ACADSBP45954 432 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 CCDC14Q49A88 953 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.01■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.01■■□□□ 1.11
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