RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANO6Q4KMQ2 910 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDKAL1Q5VV42 579 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POTEHQ6S545 545 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM270Q6UE05 265 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RRAGAQ7L523 313 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP93Q8N1F7 819 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBR7Q8N806 425 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KAT5Q92993 513 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM81BQ96LP2 452 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTLL2Q9BWV7 592 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNH6Q9H252 994 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FANCLQ9NW38 375 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.4■□□□□ 0.54
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOBPA7XYQ1 873 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TADA3O75528 432 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRFP11831 508 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD19P15391 556 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCARP24071 287 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC5A3P53794 718 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K7CLP57077 242 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP46P62068 366 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIIPQ5JXC2 388 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP17Q68EM7 881 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E2F7Q96AV8 911 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLITRK1Q96PX8 696 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMOQ99835 787 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.39■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYCE3A1L190 88 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAEPP09466 180 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPR3P17342 541 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC9A1P19634 815 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACO1P21399 889 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YWHAQP27348 245 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AVPR1AP37288 418 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP3CCP48454 512 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MFAP3P55082 362 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC8A3P57103 927 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SGO2Q562F6 1265 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC20AQ6ZU45 233 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BPIFA3Q9BQP9 254 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNPLA8Q9NP80 782 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1257Q9ULG3 409 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOTCH4Q99466 2003 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TECTAO75443 2155 aa18.38■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPYSL4O14531 572 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BEST1O76090 585 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VDRP11473 427 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT5P13647 590 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PON1P27169 355 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WEE1P30291 646 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAF10Q12962 218 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TXNDC8Q6A555 127 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MON1AQ86VX9 555 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CMTM8Q8IZV2 173 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO32Q969P5 355 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC46A2Q9BY10 475 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DUSP16Q9BY84 665 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO44Q9H4M3 255 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COMMD8Q9NX08 183 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HESX1Q9UBX0 185 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.37■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.36■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM221A6NGB7 291 aa18.36■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 M0R296 226 aa18.36■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFRSF10BO14763 440 aa18.36■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VIPR2P41587 438 aa18.36■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDE6CP51160 858 aa18.36■□□□□ 0.53
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NHLH1Q02575 133 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms