RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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ODC1-202ENST00000405333 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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ODC1-202ENST00000405333 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
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ODC1-202ENST00000405333 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa21.18■□□□□ 0.98
ODC1-202ENST00000405333 HSFY1Q96LI6 401 aa21.18■□□□□ 0.98
ODC1-202ENST00000405333 ZNF558Q96NG5 402 aa21.18■□□□□ 0.98
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ODC1-202ENST00000405333 PSMA2P25787 234 aa21.17■□□□□ 0.98
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ODC1-202ENST00000405333 TKTL1P51854 596 aa21.17■□□□□ 0.98
ODC1-202ENST00000405333 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
ODC1-202ENST00000405333 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
ODC1-202ENST00000405333 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.17■□□□□ 0.98
ODC1-202ENST00000405333 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.17■□□□□ 0.98
ODC1-202ENST00000405333 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.17■□□□□ 0.98
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