RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 BPIFA3Q9BQP9 254 aa28.89■■■□□ 2.22
GNPTAB-202ENST00000392919 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GNPTAB-202ENST00000392919 ATXN3LQ9H3M9 355 aa28.89■■■□□ 2.22
GNPTAB-202ENST00000392919 LTB4R2Q9NPC1 389 aa28.89■■■□□ 2.22
GNPTAB-202ENST00000392919 COL4A2P08572 1712 aa28.89■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM170BA6NMN3 283 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 PSMC3P17980 439 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CD58P19256 250 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GABRR2P28476 465 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GDI1P31150 447 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 VWA3BQ502W6 1294 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 AOPEPQ8N6M6 819 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 WHAMMQ8TF30 809 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 NT5C1BQ96P26 610 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TWNKQ96RR1 684 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR88Q9GZN0 384 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 HSD3B7Q9H2F3 369 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCB6Q9NP58 842 aa28.88■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 HEPACAM2A8MVW5 462 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CILPO75339 1184 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP2F1P24903 491 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TARSP26639 723 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ORC1Q13415 861 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CUL2Q13617 745 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP221Q4G0U5 840 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ITIH5Q86UX2 942 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CRYBG2Q8N1P7 616 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 DNASE1L2Q92874 299 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 PCED1BQ96HM7 432 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CRACR2AQ9BSW2 395 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 NDST4Q9H3R1 872 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 IL21Q9HBE4 155 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CISHQ9NSE2 258 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 USP34Q70CQ2 3546 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 MYO15AQ9UKN7 3530 aa28.87■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR15P49685 360 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP4F8P98187 520 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 C4orf50Q6ZRC1 276 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ACOT1Q86TX2 421 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 C1orf210Q8IVY1 113 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 MFSD6LQ8IWD5 586 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 STKLD1Q8NE28 680 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TNIP3Q96KP6 325 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ELOVL4Q9GZR5 314 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GCNT4Q9P109 453 aa28.86■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 PRR23AA6NEV1 266 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF18P17022 549 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF165P49910 485 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 VEPH1Q14D04 833 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT31Q15323 416 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR158Q5T848 1215 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF19Q8IW93 802 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 IRF7Q92985 503 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC3BQ96PB8 259 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 NT5C1AQ9BXI3 368 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 B3GNT5Q9BYG0 378 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa28.85■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP27A1Q02318 531 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 SDHAF4Q5VUM1 108 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 GBP6Q6ZN66 633 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 UBR7Q8N806 425 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 KAT5Q92993 513 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 OSBPL6Q9BZF3 934 aa28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 CLDN5O00501 218 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC9A1P19634 815 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 BDNFP23560 247 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 MAGEA11P43364 429 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 FZD5Q13467 585 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 IQCB1Q15051 598 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF852Q6ZMS4 543 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 PPM1KQ8N3J5 372 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 TTC39CQ8N584 583 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 R4GN57 208 aa28.83■■■□□ 2.21
GNPTAB-202ENST00000392919 ARNTLO00327 626 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF263O14978 683 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 FGF19O95750 216 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF12Q16514 161 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DDR2Q16832 855 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 EXOC3L4Q17RC7 722 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF394Q53GI3 561 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 PAQR9Q6ZVX9 377 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 RRAGAQ7L523 313 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM150AQ86TG1 271 aa28.82■■■□□ 2.2
GNPTAB-202ENST00000392919 C12orf29Q8N999 325 aa28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms