RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390399.3

TRBV27-201, Transcript of T cell receptor beta variable 27, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV27, Length 387 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV27-201ENST00000390399 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SEMA4DQ92854 862 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 LRRC3BQ96PB8 259 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 KRT82Q9NSB4 513 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TDP1Q9NUW8 608 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 RAB20Q9NX57 234 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.51□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 C2orf78A6NCI8 922 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FAM170BA6NMN3 283 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 H0Y858 1186 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 MAN2B1O00754 1011 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 AP1G2O75843 785 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 USP17L7P0C7H9 530 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 GLULP15104 373 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 PDE6CP51160 858 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 STX17P56962 302 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 PLCB2Q00722 1185 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ANGPT1Q15389 498 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 CAMK4Q16566 473 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 WDR44Q5JSH3 913 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FUKQ8N0W3 1084 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 NUP93Q8N1F7 819 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FAM3CQ92520 227 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SLC35C1Q96A29 364 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 MSANTD3Q96H12 275 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TWNKQ96RR1 684 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SLC22A12Q96S37 553 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 DNAI2Q9GZS0 605 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 CCL26Q9Y258 94 aa9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SHISA7A6NL88 538 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 NCAM2O15394 837 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 CILPO75339 1184 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ABL1P00519 1130 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FAM200BP0CF97 657 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 PFKLP17858 780 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 YWHAQP27348 245 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ADORA2BP29275 332 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 MAGEA9P43362 315 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 PPP3CCP48454 512 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SLC5A3P53794 718 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TAF10Q12962 218 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 USP4Q13107 963 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ZNF394Q53GI3 561 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TTC39CQ8N584 583 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 C12orf29Q8N999 325 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TTC16Q8NEE8 873 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 TTC8Q8TAM2 541 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 FBXO32Q969P5 355 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 KCNK16Q96T55 309 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 NELL2Q99435 816 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 SMOQ99835 787 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 ARID3AQ99856 593 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 GCNT4Q9P109 453 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.49□□□□□ -0.89
TRBV27-201ENST00000390399 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms