RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384161.1

RNU6-48P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 48, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-48P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-48P-201ENST00000384161 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TYRP1P17643 537 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TPH1P17752 444 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KCNA3P22001 575 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PROZP22891 400 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ACVR2AP27037 513 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 IL1R2P27930 398 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 GRIA3P42263 894 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RARRES1P49788 294 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CPT1AP50416 773 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PRKAG1P54619 331 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SOX10P56693 466 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CCNIQ14094 377 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TBCCQ15814 346 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CERCAMQ5T4B2 595 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 VPS53Q5VIR6 699 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 UNC13DQ70J99 1090 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ACRBPQ8NEB7 543 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CCDC138Q96M89 665 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TRIM5Q9C035 493 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 GLOD4Q9HC38 313 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RASA4BC9J798 803 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 hCG_1984214I3L0E3 225 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PPM1DO15297 605 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RASA4O43374 803 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 RGS10O43665 173 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TTLL1O95922 423 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CHRM2P08172 466 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 IDEP14735 1019 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ITGB6P18564 788 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 BMP5P22003 454 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 EPHA3P29320 983 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CXCR5P32302 372 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 STT3AP46977 705 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PRIM2P49643 509 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 BCAT1P54687 386 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FSTL1Q12841 308 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FOXI1Q12951 378 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 UBE4AQ14139 1066 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 NPY5RQ15761 445 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TXNRD1Q16881 649 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 IL31Q6EBC2 164 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 KRT73Q86Y46 540 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 FOXJ2Q9P0K8 574 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 DKK4Q9UBT3 224 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MID2Q9UJV3 735 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-48P-201ENST00000384161 A1L4Q6 167 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-48P-201ENST00000384161 ADM5C9JUS6 153 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-48P-201ENST00000384161 F8W8V4 182 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-48P-201ENST00000384161 RAB27BO00194 218 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-48P-201ENST00000384161 PSMD9O00233 223 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-48P-201ENST00000384161 APOL1O14791 398 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-48P-201ENST00000384161 KPNA5O15131 536 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-48P-201ENST00000384161 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-48P-201ENST00000384161 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms