RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 F5H423 210 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 PODXLO00592 558 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMTS3O15072 1205 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 NXPH3O95157 252 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSF1RP07333 972 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRM2P08172 466 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDHA1P08559 390 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 C6P13671 934 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADORA2AP29274 412 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKAR1BP31321 381 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPAP53621 1224 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCNIQ14094 377 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNAB1Q14722 419 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBCCQ15814 346 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6YL49 198 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6ZNX1 250 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SKAP1Q86WV1 359 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUPT20HQ8NEM7 779 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 MORC4Q8TE76 937 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 POF1BQ8WVV4 589 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAVIN3Q969G5 261 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 MUL1Q969V5 352 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM41AQ96HV5 264 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALG8Q9BVK2 526 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK33Q9BYT3 514 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 GLOD4Q9HC38 313 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 DKK4Q9UBT3 224 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 HPSEQ9Y251 543 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX14Q9Y5W7 946 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A087WV62 115 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A087WZ62 844 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM234BA2RU67 622 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ORC4O43929 436 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDST3O95803 873 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 HGFP14210 728 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGM1P22735 817 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPHA3P29320 983 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOLR3P41439 243 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAPPC10P48553 1259 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLCN2P51788 898 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGDP52209 483 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCAT1P54687 386 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPP3Q13368 585 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXNRD1Q16881 649 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 NBPF8Q3BBV2 869 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAXCQ5TGI0 409 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRNIPQ6NTE8 343 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAVSQ7Z434 540 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 DTX2Q86UW9 622 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABRAQ8N0Z2 381 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP2W1Q8TAV3 490 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 PBKQ96KB5 322 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX27Q96L92 541 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 COQ10AQ96MF6 247 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM5Q9C035 493 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLC4Q9NSK0 619 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.22□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAST3O60307 1309 aa3.21□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRID2IPA4D2P6 1211 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms