RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 CSF2RAP15509 400 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 CAPN2P17655 700 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 SLC11A1P49279 550 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 MAP3K7CLP57077 242 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 SLC6A3Q01959 620 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 PIGZQ86VD9 579 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.61■■□□□ 1.05
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TRIM4-202ENST00000354241 HSFY1Q96LI6 401 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM209Q96SK2 561 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 CYLDQ9NQC7 956 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.61■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 LTBP2Q14767 1821 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 KIAA0355O15063 1070 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 PSTPIP1O43586 416 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 AP1G2O75843 785 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 TSPY1Q01534 308 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 LRRC43Q8N309 656 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 GPD1P21695 349 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 RPL34P49207 117 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 VWA8A3KMH1 1905 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 KRIT1O00522 736 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 TCF4P15884 667 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 TAF5Q15542 800 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 FAM171BQ6P995 826 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.59■■□□□ 1.05
TRIM4-202ENST00000354241 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.58■■□□□ 1.04
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TRIM4-202ENST00000354241 ADIGQ0VDE8 80 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 CEP57Q86XR8 500 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM199Q8N511 208 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 PKMYT1Q99640 499 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 SMOQ99835 787 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 PLVAPQ9BX97 442 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.58■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 MARCH5Q9NX47 278 aa21.58■■□□□ 1.04
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TRIM4-202ENST00000354241 CAPN15O75808 1086 aa21.57■■□□□ 1.04
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TRIM4-202ENST00000354241 FLT3P36888 993 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 RABGGTBP53611 331 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 CLUL1Q15846 466 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 MFSD5Q6N075 450 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 LRRTM3Q86VH5 581 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 ANKRD7Q92527 254 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 PTPRDP23468 1912 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 SYN3O14994 580 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 DGKIO75912 1065 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 CACNA2D1P54289 1103 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 TRNP1Q6NT89 227 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 KRT12Q99456 494 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.57■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 LRCH4O75427 683 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 AMHP03971 560 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 ACRP10323 421 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 BDNFP23560 247 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 KCNK16Q96T55 309 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.56■■□□□ 1.04
TRIM4-202ENST00000354241 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.56■■□□□ 1.04
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