RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGZQ86VD9 579 aa28.94■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa28.89■■■□□ 2.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BNC9 293 aa28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRM6O15303 877 aa28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNPP09543 421 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL34P49207 117 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUFMP49411 452 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
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