RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 OCEL1Q9H607 264 aa23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.31■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 KBTBD13C9JR72 458 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYB561D2O14569 222 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC18A2Q05940 514 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSTA3Q16772 222 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEZ6Q53EL9 994 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 AZIN2Q96A70 460 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 LY75O60449 1722 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 INHBAP08476 426 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 GARTP22102 1010 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 YY1P25490 414 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 BST1Q10588 318 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDC16Q13042 620 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC38Q5VT99 294 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM192AQ9GZU8 254 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 NDE1Q9NXR1 346 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SCN9AQ15858 1988 aa23.3■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 F8W8V4 182 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 EXTL3O43909 919 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 BRD2P25440 801 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL1R2P27930 398 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1orf146Q5VVC0 180 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAPH1Q70E73 1250 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACAP3Q96P50 834 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 MRIQ9BWK5 157 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 EBF3Q9H4W6 596 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 MEI4A8MW99 385 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF862O60290 1169 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TM7SF2O76062 418 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACTR3P61158 418 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMD6Q15008 389 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.29■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR64B1ANS9 1081 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 LIG4P49917 911 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLDN10P78369 228 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLRN2A0PK11 232 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM49D1C9J1S8 452 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 COPEO14579 308 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 AQP5P55064 265 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMPRSS15P98073 1019 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SP4Q02446 784 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.28■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CIB2O75838 187 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP8P85298 464 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSTCDQ8NEC7 633 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTBPQ96DY7 904 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRAK4Q9NWZ3 460 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTPN7P35236 360 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 AP2B1P63010 937 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP157Q5JU67 520 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms