RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUP85Q9BW27 656 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LHX5Q9H2C1 402 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRANK1O15050 2925 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D4O60343 1298 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM163BP0C2L3 166 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP112Q8N8E3 955 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM161BQ96MY7 647 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYT15Q9BQS2 421 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTRRQ9UBK8 725 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STILQ15468 1287 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNGA2Q16280 664 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PEX26Q7Z412 305 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA18Q8TC71 538 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACBD6Q9BR61 282 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCB6Q9NP58 842 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H7C4K7 107 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FSCN2O14926 492 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CALB1P05937 261 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNPP09543 421 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MMP8P22894 467 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCSK1P29120 753 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR1D2P34982 312 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTP4A2Q12974 167 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRIN2CQ14957 1233 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK39Q9UEW8 545 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 O00370 1275 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEX28O15482 410 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRGAP2O75044 1071 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRM1P23921 792 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPS6KA1Q15418 735 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMFRQ9UKV5 643 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDH9Q9ULB4 789 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MICAL2O94851 1124 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPB1P15086 417 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSPY1Q01534 308 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKMYT1Q99640 499 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCINQ9Y6U3 715 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR6C75A6NL08 312 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC130P13994 396 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ROR1Q01973 937 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERICH1Q86X53 443 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNIP3Q96KP6 325 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR27A2RRH5 827 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 M0QYV0 167 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLDN5O00501 218 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TADA3O75528 432 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM171BQ6P995 826 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IRAK3Q9Y616 596 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms