RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CSPG5O95196 566 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-201ENST00000246533 SCP2P22307 547 aa27.75■■■□□ 2.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 MYL7Q01449 175 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-201ENST00000246533 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 NR2E1Q9Y466 385 aa27.75■■■□□ 2.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.75■■■□□ 2.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 UBN1Q9NPG3 1134 aa27.73■■■□□ 2.03
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CAPNS1-201ENST00000246533 RTN2O75298 545 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-201ENST00000246533 GZMAP12544 262 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRED3Q2MJR0 410 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-201ENST00000246533 CBWD6Q4V339 395 aa27.7■■■□□ 2.02
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