RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 CASP8Q14790 479 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 UPP1Q16831 310 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP4A22Q5TCH4 519 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 AADACL2Q6P093 401 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 C12orf29Q8N999 325 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 UBA3Q8TBC4 463 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SLCO2A1Q92959 643 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SENP8Q96LD8 212 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ADAM2Q99965 735 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 NCAPGQ9BPX3 1015 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 UBXN6Q9BZV1 441 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 EPB41L5Q9HCM4 733 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF19AQ9NV58 838 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MIOSQ9NXC5 875 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 AMACRQ9UHK6 382 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM17Q9Y577 477 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MYH10P35580 1976 aa10.04□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGEF37A1IGU5 675 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 C9IYK1 514 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 E5RJQ4 531 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF223E7ERA6 249 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 F8VP50 259 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA8SH3BPF8 625 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TLL1O43897 1013 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 GJB6O95452 261 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP11A1P05108 521 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 KRT7P08729 469 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MYBL2P10244 700 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 YY1P25490 414 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 LMO2P25791 158 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PCK1P35558 622 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 COILP38432 576 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PTGIRP43119 386 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PLA2G4AP47712 749 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SCNN1GP51170 649 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 DR1Q01658 176 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TUSC3Q13454 348 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PMF1Q6P1K2 205 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 OSTM1Q86WC4 334 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MREGQ8N565 214 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 JOSD2Q8TAC2 188 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 LPPQ93052 612 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ERP44Q9BS26 406 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 CNPY3Q9BT09 278 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 OSBPL8Q9BZF1 889 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB17Q9H0T7 212 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ACBD3Q9H3P7 528 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 DPEP3Q9H4B8 488 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM114A2Q9NRY5 505 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 ASNSD1Q9NWL6 643 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 TJP2Q9UDY2 1190 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 RASAL2Q9UJF2 1139 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 USTQ9Y2C2 406 aa10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
APOBEC1-201ENST00000229304 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 TTI1O43156 1089 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 LRCH4O75427 683 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 PDGFRBP09619 1106 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 SELPP16109 830 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 GPD1P21695 349 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 CARSP49589 748 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 CLCNKBP51801 687 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC6A3Q01959 620 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 PLCB3Q01970 1234 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 PDE4CQ08493 712 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 BFSP2Q13515 415 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 MBTPS1Q14703 1052 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 TAZQ16635 292 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 WSCD1Q658N2 575 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 DUPD1Q68J44 220 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 OR6B2Q6IFH4 312 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 OLFML1Q6UWY5 402 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC8DQ7L1W4 858 aa10.02□□□□□ -0.81
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC26A9Q7LBE3 791 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms