RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21	3e-7	■■■■■ 42.7
BRF1-222	ENST00000635152	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TRABD	Q9H4I3	376 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPM1	405 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	C22orf31	O95567	290 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD2	P08910	425 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CILP	O75339	1184 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RNF8	O76064	485 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	IL18RAP	O95256	599 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CPT1B	Q92523	772 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	USP18	Q9UMW8	372 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ALOX15B	O15296	676 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PHKA2	P46019	1235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RGS7	P49802	495 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GPX6	P59796	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	XRCC4	Q13426	336 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PTPRF	P10586	1907 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TAC1	P20366	129 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CA4	P22748	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN7	P35236	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	IL9R	Q01113	521 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	LGALS2	P05162	132 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RBP3	P10745	1247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GPD2	P43304	727 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SLC26A2	P50443	739 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	NDST1	P52848	882 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ATP11A	P98196	1134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21

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