RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CENPU	Q71F23	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ACKR2	O00590	384 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	COQ9	O75208	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	KCTD2	Q14681	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	HIF1A	Q16665	826 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MAML1	Q92585	1016 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341		A0A087WZ62	844 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TGFB3	P10600	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RGS7	P49802	495 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RAD23B	P54727	409 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	IL9R	Q01113	521 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	GHR	P10912	638 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ATP11A	P98196	1134 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MTA1	Q13330	715 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	XRCC4	Q13426	336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TAC1	P20366	129 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	KDELR1	P24390	212 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MIP	P30301	263 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	GRIK3	Q13003	919 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	P3H4	Q92791	437 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SOCS7	O14512	581 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CHUK	O15111	745 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MICAL2	O94851	1124 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	KRT4	P19013	534 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	GCK	P35557	465 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MMP19	Q99542	508 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TCEA3	O75764	348 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RNF8	O76064	485 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	INSRR	P14616	1297 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC38	Q5VT99	294 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CPT1B	Q92523	772 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25

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