RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LOXL3P58215 753 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SATB1Q01826 763 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IL10RAQ13651 578 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM187BQ17R55 369 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C4orf46Q504U0 113 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF585BQ52M93 769 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DGKKQ5KSL6 1271 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARHGAP40Q5TG30 622 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GSG1LQ6UXU4 331 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 STRA8Q7Z7C7 330 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 USP37Q86T82 979 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ATG4AQ8WYN0 398 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WBP1Q96G27 269 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CCDC17Q96LX7 622 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SIGLEC11Q96RL6 698 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZPBPQ9BS86 351 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PIF1Q9H611 641 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CAAP1Q9H8G2 361 aa2.3□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C4orf47A7E2U8 309 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BTBD19C9JJ37 291 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRKD3O94806 890 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TOMM40O96008 361 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FTH1P19P0C7X4 201 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PPIFP30405 207 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PHKA1P46020 1223 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PXNP49023 591 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TCF15Q12870 199 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 E2F2Q14209 437 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KIF22Q14807 665 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ACAP2Q15057 778 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM160B1Q5W0V3 765 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TTC7BQ86TV6 843 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CPA6Q8N4T0 437 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM46DQ8NEK8 389 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KAT5Q92993 513 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTDSS2Q9BVG9 487 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TTYH3Q9C0H2 523 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HEY2Q9UBP5 337 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AGAP1Q9UPQ3 857 aa2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CCDC154A6NI56 674 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TLR2O60603 784 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARIH2O95376 493 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PHKG2P15735 406 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RPS13P62277 151 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SNAPC2Q13487 334 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ASIC2Q16515 512 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LONRF3Q496Y0 759 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ATG9BQ674R7 924 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DEF8Q6ZN54 512 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PIP4P1Q86T03 277 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC15A3Q8IY34 581 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CHAC2Q8WUX2 184 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NR4A3Q92570 626 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UBXN4Q92575 508 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC46A1Q96NT5 459 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MOGAT1Q96PD6 335 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MMS19Q96T76 1030 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MLXIPQ9HAP2 919 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM184CQ9NVA4 438 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MCM8Q9UJA3 840 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 POLHQ9Y253 713 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IPPQ9Y573 584 aa2.28□□□□□ -2.04
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EVPLQ92817 2033 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRIM75PA6NK02 468 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRSS47A8MTI9 375 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GAS8-AS1O95177 125 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PDE6CP51160 858 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZXDBP98169 803 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SP2Q02086 613 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IQCB1Q15051 598 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C3orf36Q3SXR2 165 aa2.27□□□□□ -2.05
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AMOTQ4VCS5 1084 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms