RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC43Q8N309 656 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM130Q8N3G9 435 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA4Q8NEY3 305 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC2A14Q8TDB8 520 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MCRS1Q96EZ8 462 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CPXM1Q96SM3 734 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DUSP16Q9BY84 665 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SYN3O14994 580 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF185O15231 689 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 AMHP03971 560 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMA2P25787 234 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2C18P33260 490 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PKDCCQ504Y2 493 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO21O94952 628 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT7P08729 469 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 NPR3P17342 541 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 LMO2P25791 158 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2G4AP47712 749 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE4CQ08493 712 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 MDH1BQ5I0G3 518 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 DPF3Q92784 378 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 SCLYQ96I15 445 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC4Q9HBW1 653 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM170AA1A519 330 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ERLIN1O75477 346 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMP1P01033 207 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ERBB2P04626 1255 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC130P13994 396 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 RAG1P15918 1043 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC6A3Q01959 620 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ARCQ7LC44 396 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 OSTM1Q86WC4 334 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC30AQ86WT1 665 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CD101Q93033 1021 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.49e-10■■■■□ 24.3
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CAPNS1-212ENST00000591041 E5RJQ4 531 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 KRIT1O00522 736 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0355O15063 1070 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 GPD1P21695 349 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 POLNQ7Z5Q5 900 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 BTBD6Q96KE9 485 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CASD1Q96PB1 797 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CNPY3Q9BT09 278 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 USTQ9Y2C2 406 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 H7C4K7 107 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 BAIAP3O94812 1187 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 COPS2P61201 443 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCB1Q12824 385 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 GPNMBQ14956 572 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ELF2Q15723 593 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 C2CD6Q53TS8 623 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf74Q6P047 294 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 KATNAL2Q8IYT4 538 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
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