RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 LCTP09848 1927 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 LACTBL1A8MY62 500 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 F5H423 210 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 INSRRP14616 1297 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 BRAFP15056 766 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ABL2P42684 1182 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ASPAP45381 313 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 AGAP11Q8TF27 550 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 PGM2Q96G03 612 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 MMP19Q99542 508 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 CDT1Q9H211 546 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ZFATQ9P243 1243 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 SIX4Q9UIU6 781 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 PARP14Q460N5 1801 aa15.83■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 CNGA2Q16280 664 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 GLRA4Q5JXX5 417 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 JADE1Q6IE81 842 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 NPNTQ6UXI9 565 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 OPTNQ96CV9 577 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 CALN1Q9BXU9 219 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 VPS37BQ9H9H4 285 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ABLIM1O14639 778 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ITIH2P19823 946 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 PTK6Q13882 451 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 C1orf127Q8N9H9 656 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 TEKT4Q8WW24 435 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ARID2Q68CP9 1835 aa15.82■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 GOLGA8RI6L899 631 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 STAM2O75886 525 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 SLC1A1P43005 524 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ATP11AP98196 1134 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 VSTM1Q6UX27 236 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 CST8O60676 142 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 KRT3P12035 628 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 RFC5P40937 340 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 XRCC4Q13426 336 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ZNF677Q86XU0 584 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 WDR49Q8IV35 697 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 APOL6Q9BWW8 343 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 WHRNQ9P202 907 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 LIASO43766 372 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ERBB2P04626 1255 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 EDNRBP24530 442 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ADCYAP1R1P41586 468 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 MAGEA4P43358 317 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 BLMHQ13867 455 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 IER5Q5VY09 327 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ACTL9Q8TC94 416 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 AFG1LQ8WV93 481 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 C2CD2Q9Y426 696 aa15.81■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 WDR91A4D1P6 747 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 PIGRP01833 764 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 STAG3L1P0CL83 205 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 CUL3Q13618 768 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 CCNG2Q16589 344 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CTIF-205ENST00000587860 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms