RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	XPR1	Q9UBH6	696 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227		A1L4Q6	167 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SMIM22	K7EJ46	135 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PPEF2	O14830	753 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	IKBKB	O14920	756 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	USP1	O94782	785 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	FES	P07332	822 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP2D6	P10635	497 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ENG	P17813	658 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	HDC	P19113	662 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MPG	P29372	298 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MMP13	P45452	471 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PLCD1	P51178	756 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	IGBP1	P78318	339 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP4F2	P78329	520 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ETFDH	Q16134	617 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	C4orf46	Q504U0	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KRT73	Q86Y46	540 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GLG1	Q92896	1179 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	HPS3	Q969F9	1004 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SNX18	Q96RF0	628 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TMX2	Q9Y320	296 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF521	Q96K83	1311 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A088AWK7	358 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MYO1C	O00159	1063 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	OFD1	O75665	1012 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	NEK2	P51955	445 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GPSM2	P81274	684 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	FGL2	Q14314	439 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CHSY1	Q86X52	802 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TERB1	Q8NA31	727 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	HMCES	Q96FZ2	354 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	E2F8	A0AVK6	867 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CSF1R	P07333	972 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	PHKG2	P15735	406 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC11A2	P49281	568 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	DGKE	P52429	567 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SP2	Q02086	613 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	MYO1E	Q12965	1108 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	R3HDM4	Q96D70	268 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	RITA1	Q96K30	269 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	C5orf34	Q96MH7	638 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CGRRF1	Q99675	332 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A087WWL8	130 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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