RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 CACNA2D1P54289 1103 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 NLRP12P59046 1061 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 GRM2Q14416 872 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 UNC93AQ86WB7 457 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 SIX5Q8N196 739 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 MLKLQ8NB16 471 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 GPT2Q8TD30 523 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.28■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 ATP8B3O60423 1300 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 KMT2EQ8IZD2 1858 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 GNA14O95837 355 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 F11P03951 625 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 CCDC130P13994 396 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 FMO5P49326 533 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 INCA1Q0VD86 236 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 FAM35AQ86V20 835 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 FBXL6Q8N531 539 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 TATDN2Q93075 761 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 SPATA17Q96L03 361 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 TWNKQ96RR1 684 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 TASP1Q9H6P5 420 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.27■□□□□ 0.84
PKD1-232ENST00000566905 LRMPQ12912 555 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 VITQ6UXI7 678 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 C12orf29Q8N999 325 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 FLCNQ8NFG4 579 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 C8orf48Q96LL4 319 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 WNT16Q9UBV4 365 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.26■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 STK25O00506 426 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 CILPO75339 1184 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 CCDC192P0DO97 292 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 ZNF394Q53GI3 561 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 FUKQ8N0W3 1084 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 MYRFLQ96LU7 910 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 MED15Q96RN5 788 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 ARID3AQ99856 593 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 KRT82Q9NSB4 513 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 NCANO14594 1321 aa20.25■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 KRBA1A5PL33 1030 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 DPYSL4O14531 572 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TADA3O75528 432 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 AP1G2O75843 785 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 PSMC3P17980 439 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 RFX1P22670 979 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 ADORA2BP29275 332 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 USP46P62068 366 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TXNDC8Q6A555 127 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 KCNK16Q96T55 309 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 BRD9Q9H8M2 597 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 CISHQ9NSE2 258 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.24■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 COL4A3Q01955 1670 aa20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 PATJQ8NI35 1801 aa20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 PRAMEF12O95522 483 aa20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 GDI1P31150 447 aa20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 PFKPQ01813 784 aa20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 CETN1Q12798 172 aa20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 KCNH2Q12809 1159 aa20.23■□□□□ 0.83
PKD1-232ENST00000566905 IER5LQ5T953 404 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms