RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 IER5LQ5T953 404 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 UNC93AQ86WB7 457 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 SIX5Q8N196 739 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 TATDN2Q93075 761 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 SPATA17Q96L03 361 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 GCNAQ96QF7 691 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 WNT16Q9UBV4 365 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 CA14Q9ULX7 337 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 NPR3P17342 541 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 CD58P19256 250 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 USP46P62068 366 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 GRM2Q14416 872 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 VITQ6UXI7 678 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 FAM35AQ86V20 835 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 C12orf29Q8N999 325 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 WHAMMQ8TF30 809 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 C8orf48Q96LL4 319 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 ARID3AQ99856 593 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 TASP1Q9H6P5 420 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 TRIM66O15016 1216 aa20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 CILPO75339 1184 aa20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 CCDC130P13994 396 aa20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 FMO5P49326 533 aa20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 FUKQ8N0W3 1084 aa20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 MLKLQ8NB16 471 aa20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 PRAMEF12O95522 483 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 ANXA13P27216 316 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 WDR44Q5JSH3 913 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 TXNDC8Q6A555 127 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 KCNK16Q96T55 309 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 MED10Q9BTT4 135 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
EDC3-211ENST00000566243 GNA14O95837 355 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 PSMC3P17980 439 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 WEE1P30291 646 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 FLCNQ8NFG4 579 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 KRT82Q9NSB4 513 aa20.26■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 PMM2O15305 246 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 AVPR2P30518 371 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 LRMPQ12912 555 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 ZNF394Q53GI3 561 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 MON1AQ86VX9 555 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 SMOQ99835 787 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 CISHQ9NSE2 258 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 ATP8B3O60423 1300 aa20.25■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 AP1G2O75843 785 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 BEST1O76090 585 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 GDI1P31150 447 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 PFKPQ01813 784 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 KCNH2Q12809 1159 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 CUL2Q13617 745 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 LMO3Q8TAP4 145 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 E2F7Q96AV8 911 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 BRD9Q9H8M2 597 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 CCL26Q9Y258 94 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.24■□□□□ 0.83
EDC3-211ENST00000566243 TNFRSF10BO14763 440 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms