RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 CSH2P0DML3 217 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC130P13994 396 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CDC25CP30307 473 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 GTF2H1P32780 548 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 USP46P62068 366 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ENPEPQ07075 957 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 PAK1Q13153 545 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TXNDC8Q6A555 127 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 PAQR9Q6ZVX9 377 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TATDN2Q93075 761 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC35C1Q96A29 364 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ARID3AQ99856 593 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 BCO2Q9BYV7 579 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 IMPG2Q9BZV3 1241 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 WNT16Q9UBV4 365 aa15.8■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 FGF19O95750 216 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ANXA13P27216 316 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 AVPR2P30518 371 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 GDI1P31150 447 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 PPP1R2P41236 205 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 LRMPQ12912 555 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 VSTM1Q6UX27 236 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM35AQ86V20 835 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 C12orf29Q8N999 325 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 MED15Q96RN5 788 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNK16Q96T55 309 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TASP1Q9H6P5 420 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 RAB20Q9NX57 234 aa15.79■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 STX10O60499 249 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CD72P21854 359 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 RFX1P22670 979 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ADORA2BP29275 332 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF394Q53GI3 561 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 FUKQ8N0W3 1084 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 WHAMMQ8TF30 809 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CEP63Q96MT8 703 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXQ1Q9C009 403 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 GPR88Q9GZN0 384 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 BRD9Q9H8M2 597 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CCL26Q9Y258 94 aa15.78■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 BICDL2A1A5D9 508 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM66O15016 1216 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 BEST1O76090 585 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 PSMC3P17980 439 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TTC16Q8NEE8 873 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 PRSS33Q8NF86 280 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TTC8Q8TAM2 541 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 RIN3Q8TB24 985 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 GPT2Q8TD30 523 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 JAKMIP2Q96AA8 810 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 TNIP3Q96KP6 325 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 SPATA17Q96L03 361 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 C8orf48Q96LL4 319 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 MYRFLQ96LU7 910 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC22A12Q96S37 553 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 KRT82Q9NSB4 513 aa15.77■□□□□ 0.12
RABGGTA-211ENST00000559850 C2orf78A6NCI8 922 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 DPYSL4O14531 572 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 CILPO75339 1184 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 AP1G2O75843 785 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 FMO5P49326 533 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 INCA1Q0VD86 236 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 WDR44Q5JSH3 913 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.76■□□□□ 0.11
RABGGTA-211ENST00000559850 MON1AQ86VX9 555 aa15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms