RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 CCNE1P24864 410 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 WEE1P30291 646 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 GDI1P31150 447 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 GTF2H1P32780 548 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PFKPQ01813 784 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 LRRC63Q05C16 580 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TXNDC8Q6A555 127 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 SPATA17Q96L03 361 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 BRD9Q9H8M2 597 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PSMA7O14818 248 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CD72P21854 359 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 GRIK1P39086 918 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 NDST1P52848 882 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 NHLH1Q02575 133 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TTI2Q6NXR4 508 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 ACOT1Q86TX2 421 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 RIN3Q8TB24 985 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TWNKQ96RR1 684 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CCL26Q9Y258 94 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PTPRDP23468 1912 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 STK25O00506 426 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 P4HA1P13674 534 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 GLULP15104 373 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MXI1P50539 228 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PRKCQQ04759 706 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CBWD6Q4V339 395 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 KRT39Q6A163 491 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 PJA1Q8NG27 643 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 DNASE1L2Q92874 299 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 FAM122AQ96E09 287 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 C8orf48Q96LL4 319 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 COL4A2P08572 1712 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 INCA1Q0VD86 236 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CAMK4Q16566 473 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 FAM35AQ86V20 835 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MON1AQ86VX9 555 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 FUKQ8N0W3 1084 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 WHAMMQ8TF30 809 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 NELFBQ8WX92 580 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 E2F7Q96AV8 911 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 SHDQ96IW2 340 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 SLC22A12Q96S37 553 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-222ENST00000550996 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 ZNF263O14978 683 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 TRIM66O15016 1216 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 CCDC130P13994 396 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 NUBP1P53384 320 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 PTPN5P54829 565 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 STIM1Q13586 685 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 C12orf29Q8N999 325 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 IRF7Q92985 503 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 SLC35C1Q96A29 364 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 TNIP3Q96KP6 325 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 KCNK16Q96T55 309 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 PRRX2Q99811 253 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 OBP2AQ9NY56 170 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 C2orf78A6NCI8 922 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 CHADO15335 359 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 RFX1P22670 979 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 ANXA13P27216 316 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 UNC93AQ86WB7 457 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-222ENST00000550996 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms