RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518141.1

CPEB4-204, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 3

Gene CPEB4, Length 429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-204	ENST00000518141	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	CYP2D6	P10635	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	HSPA6	P17066	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-204	ENST00000518141		A0A087WWL8	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	TP73	O15350	636 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	AP1G1	O43747	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	MOSPD3	O75425	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CSF1R	P07333	972 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	MPG	P29372	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	DGKE	P52429	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ARFIP2	P53365	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	GPSM2	P81274	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	HTR1B	P28222	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	KRT17	Q04695	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	MAPK7	Q13164	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	UBXN7	O94888	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	KCNA3	P22001	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CTGF	P29279	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ANAPC15	P60006	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	MCL1	Q07820	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ETFDH	Q16134	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPEB4-204	ENST00000518141	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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