RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR35Q9HC97 309 aa4.56□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.56□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A0A087X0B3 334 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF398Q8TD17 642 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MEIS3Q99687 375 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CIPCQ9C0C6 399 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VTA1Q9NP79 307 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SELENONQ9NZV5 590 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBX22Q9Y458 520 aa4.55□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFITM10A6NMD0 228 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KIF20AO95235 890 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AGXTP21549 392 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TCF15Q12870 199 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STRN3Q13033 797 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANO7Q6IWH7 933 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MMS19Q96T76 1030 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SERTAD3Q9UJW9 196 aa4.54□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A1L4Q6 167 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BTBD19C9JJ37 291 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TNFRSF1BP20333 461 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GLG1Q92896 1179 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 R3HDM4Q96D70 268 aa4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BRINP1O60477 761 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GCATO75600 419 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDC25AP30304 524 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C4orf46Q504U0 113 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC17Q96LX7 622 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.52□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TLDC2A0PJX2 215 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 F2RL2O00254 374 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RARBP10826 455 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC16A1P53985 500 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GYS2P54840 703 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SP2Q02086 613 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LAYNQ6UX15 382 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAP4K1Q92918 833 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LMLNQ96KR4 655 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.51□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NGFRP08138 427 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HSD3B2P26439 372 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CUZD1Q86UP6 607 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MMP21Q8N119 569 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF479Q96JC4 524 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP35Q9P2H5 1018 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GABRQQ9UN88 632 aa4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GNAI2P04899 355 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRKCBP05771 671 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CTSAP10619 480 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.49□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACOT8O14734 319 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MALP21145 153 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMARCA1P28370 1054 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SOX5P35711 763 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LOXL3P58215 753 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PDXDC1Q6P996 788 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC4A10Q6U841 1118 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP37Q86T82 979 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.48□□□□□ -1.69
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms