RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507197.5

SNHG4-204, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 2 BASIC

Gene SNHG4, Length 865 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-204	ENST00000507197	GJA4	P35212	333 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	GRIK1	P39086	918 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	PPP3CC	P48454	512 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	GALK1	P51570	392 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CD101	Q93033	1021 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ACD	Q96AP0	544 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	UBE4B	O95155	1302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TCHH	Q07283	1943 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TADA3	O75528	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	NFATC1	O95644	943 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	EGF	P01133	1207 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	HDC	P19113	662 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TNNI1	P19237	187 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ASIC1	P78348	528 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	USP4	Q13107	963 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ZNF77	Q15935	545 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TACC1	O75410	805 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	YEATS4	O95619	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	E2F4	Q16254	413 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	EML3	Q32P44	896 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	SYT13	Q7L8C5	426 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	AXIN1	O15169	862 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CUTA	O60888	179 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	EPN2	O95208	641 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	APBB3	O95704	486 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	BDNF	P23560	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	LMO2	P25791	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	LIMK1	P53667	647 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TNNC1	P63316	161 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	PSMD2	Q13200	908 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TRPC3	Q13507	836 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ELF2	Q15723	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	C11orf74	Q86VG3	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	DHX58	Q96C10	678 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CHFR	Q96EP1	664 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SNHG4-204	ENST00000507197	EBF1	Q9UH73	591 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms