RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CEP350Q5VT06 3117 aa6.97□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DENND3A2RUS2 1198 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PIAS1O75925 651 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RALAP11233 206 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSPA6P17066 643 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADCY8P40145 1251 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAS2R40P59535 323 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NCALDP61601 193 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPLD1P80108 840 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SP4Q02446 784 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MGAT5Q09328 741 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RASIP1Q5U651 963 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRT39Q6A163 491 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ECT2Q9H8V3 914 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAB20Q9NX57 234 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.96□□□□□ -1.29
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 P4HA2O15460 535 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GGPS1O95749 300 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTC4O95801 387 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ETS1P14921 441 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BRAFP15056 766 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCF4P15884 667 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD58P19256 250 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDC25CP30307 473 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FOXN2P32314 431 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NF2P35240 595 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SOX9P48436 509 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDE6CP51160 858 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSD17B4P51659 736 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTMR1Q13613 665 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYBPC2Q14324 1141 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITIH4Q14624 930 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MFSD5Q6N075 450 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANO5Q75V66 913 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FITM2Q8N6M3 262 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXO27Q8NI29 283 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DCLK3Q9C098 648 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPT2Q9UMR5 302 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNTNAP1P78357 1384 aa6.96□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 THAP12O43422 761 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPAG7O75391 227 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCNTO95613 3336 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRT16P08779 473 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRT10P13645 584 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MUTP22033 750 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PSMC4P43686 418 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NCKAP1LP55160 1127 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LMNB2Q03252 620 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYT9Q86SS6 491 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AGAP11Q8TF27 550 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WNK4Q96J92 1243 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NT5C1BQ96P26 610 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms