RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489845.1

DCLRE1C-215, Transcript of DNA cross-link repair 1C, humanhuman

TSL 3

Gene DCLRE1C, Length 294 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1C-215ENST00000489845 L1RE1Q9UN81 338 aa3.57□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 FAM50BQ9Y247 325 aa3.57□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 POLHQ9Y253 713 aa3.57□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ABCA3Q99758 1704 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 USP54Q70EL1 1684 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TMEM233B4DJY2 109 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 APAF1O14727 1248 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TRIM24O15164 1050 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 NPHP1O15259 732 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 SLC16A6O15403 523 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 HMOX1P09601 288 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 YY1P25490 414 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 GNALP38405 381 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 SCAPQ12770 1279 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RESTQ13127 1097 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TP53BP2Q13625 1128 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 KIF22Q14807 665 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 GEN1Q17RS7 908 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ANO6Q4KMQ2 910 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ZNF790Q6PG37 636 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 DAAM2Q86T65 1068 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 IL31RAQ8NI17 732 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 C8orf48Q96LL4 319 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 WDCPQ9H6R7 721 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 BRD9Q9H8M2 597 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ETAA1Q9NY74 926 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 EP400Q96L91 3159 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 AKAP12Q02952 1782 aa3.56□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 MEGF6O75095 1541 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 M0QYG6 137 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ERC2O15083 957 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TBX3O15119 743 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ANP32CO43423 234 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 SUN1O94901 812 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 SPDEFO95238 335 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CFIP05156 583 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ALAS1P13196 640 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RHCEP18577 417 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 MGAT1P26572 445 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 PRKAR2BP31323 418 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RHDQ02161 417 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TUBA3CQ13748 450 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 FGL2Q14314 439 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TUBA3EQ6PEY2 450 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 Q6ZPA2 131 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ZNF627Q7L945 461 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 MRGPREQ86SM8 312 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 DGKHQ86XP1 1220 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 VRK3Q8IV63 474 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ASB10Q8WXI3 467 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 VPS11Q9H270 941 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 RSAD1Q9HA92 442 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 GPR35Q9HC97 309 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CHST12Q9NRB3 414 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 NARFQ9UHQ1 456 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 LRRC37A3O60309 1634 aa3.55□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 COL18A1P39060 1754 aa3.54□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
DCLRE1C-215ENST00000489845 CFAP69A5D8W1 941 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms