RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 F8VP50 259 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TRIM66O15016 1216 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CD58P19256 250 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 VIPR2P41587 438 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 GPC5P78333 572 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 FUKQ8N0W3 1084 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TASP1Q9H6P5 420 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 P4HA2O15460 535 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CFHP08603 1231 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CCDC192P0DO97 292 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 FAM35AQ86V20 835 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 C12orf29Q8N999 325 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 GCNAQ96QF7 691 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ARID3AQ99856 593 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 WNT16Q9UBV4 365 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 PTPRDP23468 1912 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TADA3O75528 432 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CCDC130P13994 396 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ANXA13P27216 316 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 WEE1P30291 646 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 USP46P62068 366 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 KCNH2Q12809 1159 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 LMO3Q8TAP4 145 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 MED10Q9BTT4 135 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CISHQ9NSE2 258 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.154e-16■□□□□ 9.9
ACTB-211ENST00000480301 NCANO14594 1321 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 LRMPQ12912 555 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 VITQ6UXI7 678 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 KCNK16Q96T55 309 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 DACH1Q9UI36 760 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ATP8B3O60423 1300 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TRIOO75962 3097 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 SOBPA7XYQ1 873 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 MBD3O95983 291 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CUL2Q13617 745 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ZNF394Q53GI3 561 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC8Q6A555 127 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 FBXL6Q8N531 539 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TTC39CQ8N584 583 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 SMOQ99835 787 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 KRT82Q9NSB4 513 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 KRBA1A5PL33 1030 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 AP1G2O75843 785 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 BEST1O76090 585 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 NPR3P17342 541 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 PSMC3P17980 439 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.153e-35■■□□□ 11.9
ACTB-211ENST00000480301 CETN1Q12798 172 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 GRM2Q14416 872 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 IER5LQ5T953 404 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 MON1AQ86VX9 555 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 SIX5Q8N196 739 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 UBR7Q8N806 425 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 E2F7Q96AV8 911 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 CA14Q9ULX7 337 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF10BO14763 440 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF12O95522 483 aa22.22■■□□□ 1.15
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