RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 IQCEQ6IPM2 695 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOT1Q86TX2 421 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf29Q8N999 325 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA18Q8TC71 538 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A12Q96S37 553 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ARID3AQ99856 593 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 BCO2Q9BYV7 579 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX25Q9H3E2 840 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ASAH2Q9NR71 780 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB3Q9Y575 518 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 USP34Q70CQ2 3546 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 HEPACAM2A8MVW5 462 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MXQ7 604 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 F8VP50 259 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF197O14709 1029 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 NOL4O94818 638 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF12O95522 483 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CALCAP01258 141 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SRFP11831 508 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT13P13646 458 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC130P13994 396 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 GLULP15104 373 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 PCSK1P29120 753 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 AVPR2P30518 371 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP12P59046 1061 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ZXDBP98169 803 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP27A1Q02318 531 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ENPEPQ07075 957 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SMARCB1Q12824 385 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR44Q5JSH3 913 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR158Q5T848 1215 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNDC8Q6A555 127 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 FUKQ8N0W3 1084 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ELMOD1Q8N336 334 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL6Q8N531 539 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS33Q8NF86 280 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 LMO3Q8TAP4 145 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 KAT5Q92993 513 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 NXPE3Q969Y0 559 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35C1Q96A29 364 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP2S1Q96SQ9 504 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNK16Q96T55 309 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SMOQ99835 787 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCB6Q9NP58 842 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB20Q9NX57 234 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 GDE1Q9NZC3 331 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CCL26Q9Y258 94 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf78A6NCI8 922 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HHLA1C9JL84 531 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ARNTLO00327 626 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF10BO14763 440 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ECI2O75521 394 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CSH1P0DML2 217 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CSH2P0DML3 217 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CD72P21854 359 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2H1P32780 548 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIK1P39086 918 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms