RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
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ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31D3P0C874 917 aa31.32■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 LCLAT1Q6UWP7 414 aa31.32■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa31.32■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa31.32■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 Q7L0L9 218 aa31.32■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 CRISPLD1Q9H336 500 aa31.32■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 PPP2R3CQ969Q6 453 aa31.31■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 ABCB6Q9NP58 842 aa31.31■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 KRT82Q9NSB4 513 aa31.31■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa31.31■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 MTCH2Q9Y6C9 303 aa31.31■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 HESX1Q9UBX0 185 aa31.31■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa31.3■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 IGFBP4P22692 258 aa31.3■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 CYP4F11Q9HBI6 524 aa31.3■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 M0QYV0 167 aa31.29■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 ELF1P32519 619 aa31.29■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 TCEAL5Q5H9L2 206 aa31.29■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 PDCL3Q9H2J4 239 aa31.29■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM30AQ9NV96 361 aa31.29■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 FBXW11Q9UKB1 542 aa31.29■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 MAFFQ9ULX9 164 aa31.29■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 ANXA13P27216 316 aa31.28■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP31.28■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa31.28■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 C1RP00736 705 aa31.27■■■□□ 2.6
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ECHS1-201ENST00000368547 PASD1Q8IV76 773 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 TCEAL8Q8IYN2 117 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 SYT11Q9BT88 431 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 HSFX1Q9UBD0 423 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 SOAT2O75908 522 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 BEST1O76090 585 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 NPR3P17342 541 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 BCAT1P54687 386 aa31.27■■■□□ 2.6
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