RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 FGFR3P22607 806 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CYP2F1P24903 491 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 GPR15P49685 360 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 NDUFV1P49821 464 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 EMC1Q8N766 993 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 GPR152Q8TDT2 470 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 RFFLQ8WZ73 363 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 SMOQ99835 787 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 LHX5Q9H2C1 402 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CDH9Q9ULB4 789 aa14.68□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 NCANO14594 1321 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 LCP1P13796 627 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TTC39CQ8N584 583 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ZNF558Q96NG5 402 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ACBD6Q9BR61 282 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 SYNCQ9H7C4 482 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 HESX1Q9UBX0 185 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CEP83Q9Y592 693 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TRAPPC3O43617 180 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 AP1G2O75843 785 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TYMPP19971 482 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 MAMLD1Q13495 774 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 PIGZQ86VD9 579 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.67□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 SRGAP2O75044 1071 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 OAZ2O95190 189 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 EFEMP2O95967 443 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CYP1A2P05177 515 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 PCSK1P29120 753 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 RAB6CQ53S08 254 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 FAM171BQ6P995 826 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 XYLT1Q86Y38 959 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 MCEEQ96PE7 176 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TTPALQ9BTX7 342 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 DSEQ9UL01 958 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 VNN2O95498 520 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 PBX2P40425 430 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 OGDHQ02218 1023 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 MESDQ14696 234 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 FIBCD1Q8N539 461 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 NOX5Q96PH1 765 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CXCR5P32302 372 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TRNP1Q6NT89 227 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 DAAM2Q86T65 1068 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TMEM169Q96HH4 297 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CERS4Q9HA82 394 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 INSL6Q9Y581 213 aa14.66□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 NPR3P17342 541 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 CA8P35219 290 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 BCAT1P54687 386 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 ADIGQ0VDE8 80 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 C18orf8Q96DM3 657 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 DUSP16Q9BY84 665 aa14.65□□□□□ -0.06
PMS1-201ENST00000342075 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms